Ученые завершили крупное исследование по генетическому анализу опухолей

Ученые из Школы медицины Вашингтонского университета в Сент-Луисе и других учреждений завершили генетическое секвенирование и анализ более 11 000 опухолей у пациентов с 33 типами рака. Проект, финансируемый Национальным институтом рака и Национальным институтом исследований генома человека, называется The Cancer Genome Atlas (TCGA).

Исследователи выявили 300 генов, которые приводят к росту опухоли. И, что удивительно, более половины всех анализируемых опухолей переносят генетические мутации, которые могут быть нацелены на терапию.

TCGA была запущен в 2005 году для изучения генетической основы рака. Результаты опубликованы 5 апреля. «Мы проанализировали 10 000 опухолей, изучили наследственные мутации, приводящие к раку, и генетические ошибки, которые накапливаются с возрастом», - говорит ведущий исследователь TCGA Ли Дин, доцент медицины в Вашингтонском университете.

Исследования показали, что рак является результатом ошибок в генах, а не в отдельных органах.  «Теперь мы используем молекулярные признаки, чтобы идентифицировать клетку рака, - говорит Дин. - Мы смотрим, какие гены включены в опухоль, и определяем тип клеток. Например, злокачественные раковые клетки могут возникать в легких, мочевом пузыре или шейке матки. Традиционно эти раковые заболевания лечат по-разному, но, изучая их молекулярные особенности, мы теперь знаем, что они тесно связаны. Виды рака, начинающиеся в эпителиальных клетках, тесно связаны друг с другом независимо от их местоположения».

Исследование подтверждает идею о том, что опухоли любого типа с большим количеством мутаций, которые устойчивы к химиотерапии, восприимчивы к препаратам иммунотерапии. Исследования также дают понимание о значимости определенных мутаций в гене BRCA1, которые приводят к раку груди и яичников. Специфические мутации этого гена значительно повышают риск развития определенных типов рака. Но последствия многих других мутаций в этом гене были неизвестны, что затрудняет прогнозирование риска развития рака.

«Мы давно знаем, что BRCA1 является важным геном в развитии рака, - говорит Дин. - Но сложно определить, какие специфические мутации в BRCA1 действительно приводят к раку, а какие являются безвредными. Статья о вариантах, вызывающих рак, дает понимание в отношении мутаций BRCA1, фактически влияющих на рост опухоли. Мы обнаружили варианты BRCA1 и BRCA2 при раке молочной железы, раке шейки матки и колоректальном раке».

В ходе исследования пациенты по-разному реагировали на экспериментальную терапию, и исследователи не понимали, почему. «Ранние испытания не разработаны с учетом геномики, - говорит Дин. - Теперь мы можем упорядочить образцы опухолей у пациентов, включенных в эти испытания, с помощью новых программных данных. Мы можем искать взаимосвязь между геномикой пациентов и  реакцией на лечение. Теперь у нас есть значительные статистические данные для выявления причин, по которым лекарства не работают. Мы планируем расширить рамки исследований опухолевых клеток, включив в них опухолевую экосистему: иммунные клетки, которые проникают в опухоль, и окружающие ткани».

Источник: medicalxpress.com/news/2018-04-major-milestone-effort-id-cancers