Новый подход к скринингу показывает важность микроРНК в жизненном цикле ВПЧ

Обнаружение микроРНК, кодируемых папилломавирусами, подтверждает важную роль этих малых молекул в персистирующей инфекции, согласно исследованию, опубликованному 26 июля в журнале PLOS Pathogens открытого доступа. Автор исследования Рейчел Чирайил из Техасского университета в Остине и его коллеги сделали это открытие, используя новый подход, который позволяет идентифицировать микроРНК для огромного диапазона патогенов, которые имеют геномные данные, но не могут быть культивированы в лабораторных условиях.

Папилломавирусы могут вызывать несколько видов рака у людей, но остается неясным, почему только некоторые инфекции приводят к развитию злокачественных опухолей. Чтобы ответить на этот вопрос, необходимо лучше охарактеризовать продукты гена папилломы и их роль в жизненном цикле этих патогенов. МикроРНК представляют собой небольшие РНК, которые регулируют различные биологические процессы, включая взаимодействия хозяев-патогенов. Следовательно, микроРНК обычно кодируются вирусами, которые подвергаются длительной стойкой инфекции. Но до сих пор не было обнаружено широко распространенных микроРНК, закодированных вирусом папилломы, отчасти из-за отсутствия подходящих лабораторных моделей.

Чтобы преодолеть это препятствие, исследователи разработали новую технологию мокрого скамья под названием microRNA Discovery путем принудительной экспрессии генома (miDGE). Эта широко применимая методология может одновременно скринировать многочисленные генотипы патогенов, идентифицируя микроРНК от организмов, лишенных лабораторной системы культуры. Используя miDGE, они скринировали более 73 различных геномов папилломавируса для способности кодировать микроРНК.

Большинство папилломавирусов, по-видимому, не кодируют микроРНК, но исследователи обнаружили пять новых высоко вероятных микроРНК, кодируемых вирусом папилломы. Хотя микроРНК papillomavirus не экспрессируются в раках, связанных с инфекцией высокого риска, некоторые из них контролируют экспрессию вирусных генов. По мнению авторов, результаты показывают, что микроРНК являются важными регуляторами жизненного цикла папилломы.

«Важнейшим аспектом этой работы является то, что эта новая технология открывает параллельное исследование многочисленных патогенов в одном эксперименте, - добавляет исследователь Кристофер Салливан, - что позволяет проводить глубокие эволюционные перекрестные сравнения».

Источник:https://www.sciencedaily.com/releases/2018/07/180726162743.htm