Единый анализ для всех видов рака

Исследователи из Института генетики рака и информатики в университетской больнице Осло разработали метод, который может оценить серьезность заболевания пациента и требуемое лечение.

Анализ поможет понять развитие почти всех видов рака. Результаты опубликованы в The Lancet Oncology.

На сегодняшний день нет единого анализа для диагностики и прогнозирования рака. Вместо этого для различных типов рака используются различные тесты и методы. Немногие из них дают ответ, как будет развиваться рак. Выявить пациентов, которым потребуется дополнительное лечение после операции, не так просто. Значительное число пациентов  получают ненужное лечение, что может вызвать побочные эффекты.

Новые результаты исследований основаны на 20-летнем сотрудничестве между Департаментом генетики рака и информатики и Департаментом информатики Университета Осло. Метод полезен для выявления пациентов с раком кишечника II стадии, которым потребуется дополнительное лечение после операции, например, химиотерапия. Эксперименты показывают, что этот метод может быть использован для рака яичников, рака матки и рака предстательной железы.

Исследование основано на анализе хроматина 461 000 цифровых изображений окрашенных ДНК раковых клеток 390 пациентов с раком кишечника I или II стадии. Кроме того, тот же аналитический метод применяется к образцам опухолей шести групп пациентов из разных стран, главным образом из Норвегии и Соединенного Королевства.

Хотя у видов рака разные характеристики, существуют некие общие черты, которые могут быть использованы при понимании тяжести заболевания и потребностей в лечении. Один из них заключается в том, что рак начинается с дисфункции ДНК, которую организм не может восстановить.

ДНК человека содержит 23 000 генов, в дополнение к областям, которые контролируют их активность. ДНК образуется как двойная спиральная нить, где гены находятся в одной линии друг с другом. Гетерогенная или неправильная организация генов представляет риск для пациента. Разработанный метод основан на технологии, называемой автоматизированным анализом изображений. Изображения образцов клеток и тканей переносятся на компьютер из микроскопа и изучаются по частям.  Метод получил название «нуклеотипирование».

Новые результаты исследований показывают, что нуклеотипирование является хорошей основой для оценки развития рака.

Результаты включены в исследовательский проект DoMore, в котором будут использоваться новые технологии для решения вопросов, связанных с лечением рака. Технологическое развитие последних лет открыло возможности для получения глубокого понимания того, что происходит в опухоли. Используя методы и инструменты, например, объемные базы данных и машинное обучение, исследователи смогут сравнивать большие объемы информации, включая микроскопические изображения.

Источник: https://medicalxpress.com/news/2018-02-cancer.html